В недавнем исследовании, размещенном на сервере medRxiv *, группа исследователей исследовала, как концентрация антигена и вирусная нагрузка в различных типах образцов влияют на эффективность экспресс-тестов (ДЭТ) на коронавирус тяжелого острого респираторного синдрома 2 (SARS-CoV-2).

Фон

Понимание динамики концентрации антигена и вирусной нагрузки в различных типах образцов может дать информацию о том, как ДЭТ работают на разных стадиях инфекции и в сценариях использования коронавирусной болезни 2019 (COVID-19). Обе эти переменные, концентрация нуклеокапсидного (N)-антигена и вирусная нагрузка различаются для разных типов образцов и у разных людей. Кроме того, относительная вирусная нагрузка зависит от варианта SARS-CoV-2 и статуса вакцинации.

Обратная транскриптаза-полимеразная цепная реакция (ОТ-ПЦР) остается золотым стандартом для обнаружения SARS-CoV-2 в образцах мазка из носоглотки (NPS) независимо от источника образца для индексного теста. Концентрация антигена в образцах ротовой или носовой полости и копий вируса в образцах НПВ ограничивала возможности сравнения эффективности БДТ по сравнению с ОТ-ПЦР. Тем не менее, эффективность ДЭТ сравнивали с ОТ-ПЦР на ранних этапах пандемии COVID-19 в целях регулирования.

Об исследовании

В настоящем исследовании исследователи представили результаты измерений концентрации эталонного антигена в образцах, собранных для исследования, проведенного в Порту-Велью, Бразилия, в 2021 году для определения корреляции между концентрацией антигена и вирусной нагрузкой на эффективность ДЭТ.

Gaia Herbs, Turmeric Supreme, куркума, повышенная сила действия, 120 веганских фито-капсул с жидкостью

В исследование были включены 214 контактов в возрасте 12 лет и старше с разным статусом вакцинации, с недавним контактом с подтвержденными случаями COVID-19. Они измеряли концентрацию антигена в NPS, мазках из носа (ANS) и образцах слюны. Впоследствии они провели ОТ-ПЦР на образцах НПВ и слюны. Аналогичным образом они провели два ДЭТ на образцах ВНС и один — на образцах слюны.

Результаты исследования         

Концентрация антигена NPS соответствовала вирусной нагрузке NPS, а концентрация антигена в слюне, измеренная в образцах слюны, коррелировала со значениями порога цикла (C T ) из анализа SalivaDirect. Однако концентрации антигена в образцах ВНС и слюны не коррелировали с вирусной нагрузкой, измеренной в образцах НПС тех же участников исследования. Результаты подтвердили более высокие концентрации антигена в симптоматических случаях по сравнению с бессимптомными и малосимптомными случаями во всех трех типах образцов. Общий более низкий уровень антигена, наблюдаемый в слюне в этом исследовании, свидетельствует о том, что используемые в настоящее время крысы недостаточно чувствительны, чтобы использовать эту возможность для раннего обнаружения инфекции SARS-CoV-2.

Исследуемая популяция включала симптоматические, бессимптомные и малосимптомные случаи. Аналогичным образом, исследуемые образцы имели низкую вирусную нагрузку и низкие концентрации антигена. Большие наборы данных парных измерений вирусной нагрузки и концентрации антигена для разных типов образцов, вариантов и разных исследуемых популяций могут улучшить способность прогнозировать эффективность тестов обнаружения антигена в различных сценариях и вариантах использования.

Это исследование показало, что возможны противоречивые результаты, если источник образца для БДТ отличается от образца, используемого для измерения вирусной нагрузки с помощью ОТ-ПЦР. В пределах типа образца концентрация антигена и эффективность теста на обнаружение на основе антигена могут быть связаны с вирусной нагрузкой. Таким образом, несоответствие между результатами ОТ-ПЦР на образцах НПВ и ДЭТ, проведенных на ВНС, может быть связано со значениями концентрации антигена. Эти результаты также объясняют различия в эффективности тестов на SARS-CoV-2 для разных типов образцов.

Выводы

Текущее исследование показало ценность понимания лежащей в основе динамики концентрации антигена и ее связи с вирусной нагрузкой в ​​различных типах образцов для информирования и прогнозирования эффективности БДТ в различных условиях, вариантах SARS-CoV-2 и вариантах использования.

Образцы слюны имеют более низкие концентрации антигена, поэтому тесты с использованием образцов слюны требуют большей аналитической чувствительности для достижения клинической чувствительности, сравнимой с назальными образцами. Динамика антигенов в разных типах образцов, наблюдаемая при прогрессировании заболевания SARS-CoV-2, подтверждает использование ДЭТ в образцах из носа. Подводя итог, можно сказать, что аналитический предел обнаружения ДЭТ может помочь предсказать эффективность ДЭТ в популяциях, для которых известна концентрация антигена.

*Важное замечание

medRxiv публикует предварительные научные отчеты, которые не рецензируются экспертами и, следовательно, не должны рассматриваться как окончательные, направляющие клиническую практику/поведение, связанное со здоровьем, или рассматриваться как установленная информация.