Доступность экспресс- тестов на антигены значительно продвинула усилия по сдерживанию распространения COVID-19, но каждый новый вызывающий озабоченность вариант вызывает вопросы о том, будут ли диагностические тесты по-прежнему эффективны. Новое исследование, опубликованное в Cell , пытается ответить на эти вопросы, оценивая, как будут работать экспресс-тесты при тестировании будущих вариантов SARS-CoV-2.

Исследовательская группа, возглавляемая Университетом Эмори и финансируемая Технической программой быстрого ускорения диагностики (RADx) Национального института здравоохранения (NIH), разработала новый метод оценки того, как мутации SARS-CoV-2 могут влиять на распознавание антителами, используемыми в экспресс-тесты на антигены. Поскольку большинство экспресс-тестов на антиген обнаруживают нуклеокапсидный белок SARS-CoV-2 (белок N), команда ученых напрямую измерила, как мутации в белке N влияют на способность диагностических антител распознавать свою цель.

«Исходя из наших выводов, ни один из основных прошлых и настоящих вариантов SARS-CoV-2, вызывающих озабоченность, не содержит мутаций, которые могли бы повлиять на способность современных экспресс-тестов на антигены обнаруживать антитела», — говорит первый автор исследования Филипп Франк, доктор философии. доцент кафедры биохимии Университета Эмори. «Кроме того, эти данные позволяют нам заглянуть на шаг вперед и спрогнозировать эффективность тестирования практически для любого варианта, который может возникнуть».

В исследовании использовался метод, называемый глубоким мутационным сканированием, для оценки всех возможных мутаций в белке N в одном высокопроизводительном эксперименте. Затем исследователи измерили влияние мутаций на их взаимодействие с антителами, используемыми в 11 коммерчески доступных экспресс-тестах на антигены, и идентифицировали мутации, которые могут привести к ускользанию антител.

Точная и эффективная идентификация инфицированных остается критически важной стратегией смягчения последствий COVID-19, и наше исследование предоставляет информацию о будущих мутациях SARS-CoV-2, которые могут помешать обнаружению. Изложенные здесь результаты могут позволить нам быстро адаптироваться к вирусу, поскольку новые варианты продолжают появляться, что представляет собой непосредственное клиническое воздействие и влияние на общественное здравоохранение».

Эрик Ортлунд, доктор философии, старший автор исследования, профессор кафедры биохимии Университета Эмори

Результаты показывают, что варианты относительно редко имеют мутации в белке N, которые позволяют им уклоняться от диагностических тестов, но есть небольшая доля последовательностей, которые могут повлиять на обнаружение. Исследователи, должностные лица общественного здравоохранения и производители тестов могут использовать эти данные, чтобы определить, нужно ли оценивать диагностический тест на его способность обнаруживать эти мутации или информировать о будущем дизайне теста.

«Учитывая бесконечный цикл новых вариантов, данные этого исследования будут полезны в ближайшие годы», — говорит Брюс Дж. Тромберг, доктор философии, директор Национального института биомедицинской визуализации и биоинженерии (NIBIB) и руководитель исследования. программа RADx® Tech в NIH.

Хотя многие варианты, вызывающие озабоченность, содержат множественные мутации белка N, авторы исследования отмечают, что их метод не оценивает, как множественные мутации могут повлиять на распознавание диагностических антител, что представляет собой ограничение исследования.

Проект был поддержан NIBIB под номерами наград 75N92019P00328, U54EB015408 и U54EB027690 в рамках инициативы RADx, запущенной для ускорения инноваций в разработке, коммерциализации и внедрении технологий для тестирования COVID-19.