Остатки древних вирусов в геноме человека активны как в здоровых, так и в больных тканях, что ограничивает их полезность в качестве биомаркеров заболеваний, согласно исследованию Эйдана Берна из Университета Тафтса в Бостоне, США, и его коллег, опубликованному 18 октября в открытом доступе . доступ к журналу PLOS Biology .

Вирусная инфекция сперматозоидов или яйцеклеток может привести к постоянному включению вирусных генов в геном хозяина, а генетические остатки древних вирусов -; известные как эндогенные ретровирусы человека (HERV) -; составляют около 8% генома человека. Хотя некоторые HERV больше не заразны, некоторые HERV все еще содержат интактные гены, а продукция транскриптов РНК HERV в клетках человека связана с некоторыми видами рака.

Однако экспрессия HERV в здоровых тканях практически не изучена. Чтобы восполнить этот пробел в знаниях, исследователи использовали данные о последовательности РНК из проекта Genotype Tissue and Expression для изучения присутствия транскриптов, принадлежащих к недавней подгруппе HERV, HML-2, в здоровых тканях. Эта база данных включает данные об экспрессии генов из 54 различных типов тканей, собранных почти у 1000 человек. Авторы обнаружили транскрипты HML-2 во всех типах тканей с повышенным уровнем в тканях мозжечка, гипофиза, яичек и щитовидной железы.

Результаты демонстрируют, что активность HML-2 не ограничивается больными или раковыми тканями, и это имеет важное клиническое значение. Например, при использовании экспрессии HML-2 в качестве биомаркера рака или мишени для терапии необходимо учитывать фоновую экспрессию в здоровых тканях. Эволюционно более древние вирусы HML-2 показали самые высокие уровни экспрессии в тканях человека, что может указывать на то, что активность более молодых, менее деградировавших фрагментов HERV, содержащих полные последовательности, кодирующие белок, может подавляться клетками, чтобы предотвратить продукцию вредных вирусных белков. говорят авторы.

Мы обнаружили, что почти все нормальные ткани человека экспрессируют в своей РНК тот или иной из примерно трех десятков эндогенных провирусов, остатков широко распространенной ретровирусной инфекции наших далеких предков. Мы ожидаем, что это открытие послужит основой для дальнейших исследований, чтобы понять роль этих элементов в биологии и болезнях человека».

Джон Коффин, старший автор