В недавнем исследовании, размещенном на сервере препринтов medRxiv *, исследователи оценили значения основного репродукционного числа (R 0 ) для конкретных регионов для MSA (столичных статистических районов) в США (США) на основе компартментного моделирования с воспроизведенным тяжелым острым синдромом коронавируса 2. (SARS-CoV-2) данные эпиднадзора.

Усилия по наблюдению за коронавирусным заболеванием 2019 (COVID-19) в США предоставили ценную информацию о динамике передачи SARS-CoV-2 в стране. Несколько районов США были одновременно поражены одним патогенным вирусом (SARS-CoV-2) в начале пандемии SARS-CoV-2. Таким образом, сравнение оценок COVID-19 R 0 по регионам может прояснить, как объединяются характеристики населения в разных районах для определения дифференциальной восприимчивости к SARS-CoV-2.

Первоначальную передачу возбудителя инфекционного заболевания в конкретной популяции можно количественно оценить на основе значений R 0 , которые обеспечивают ожидаемое количество новых случаев COVID-19, вызванных инфицированным человеком в восприимчивой популяции, в зависимости от свойств возбудитель и популяция. Авторы настоящего исследования ранее разработали модель раздельного анализа, которая могла воспроизводить ежедневные данные о количестве случаев заражения SARS-CoV-2 для 15 наиболее населенных MSA США и всех 50 штатов США.

Об исследовании

В настоящем исследовании исследователи использовали свою ранее разработанную модель для оценки региональных оценок COVID-19 R 0 для 280 из 384 MSA США, что составляет 95% и 82% населения США, проживающего в городских районах, и всего населения соответственно.

Для анализа использовался подход на основе компартментальной модели, для которого требуется однородная популяция. Чтобы выяснить, происходит ли передача SARS-CoV-2 более однородно в округах или штатах MSA США, были использованы три показателя изменчивости (коэффициент Джини, расстояние Вассерштейна-1 и фактор Фано) для оценки изменчивости показателей заболеваемости COVID-19 в неделю (т. , риск заражения SARS-CoV-2 в течение семи дней).

Gummiology, жевательный витамин D3 для взрослых, без желатина, со вкусом персика и вишни, 100 вегетарианских жевательных таблеток

Компартментальная модель рассматривала начальный период НПИ (немедикаментозных вмешательств)/социального дистанцирования, в течение которого часть людей придерживалась поведения, направленного на избегание болезней. Напротив, остальные люди свободно занимались общественной деятельностью, не принимая мер предосторожности для предотвращения COVID-19.

Три показателя изменчивости были нанесены на график в зависимости от эпидемиологической недели для выбранных MSA и перекрывающихся состояний. Были проанализированы гистограммы усредненных по времени мер изменчивости для MSA с несколькими округами и штатами. Для каждого MSA был применен подход байесовского вывода, обеспечиваемый процедурой выборки MCMC (марковская цепь Монте-Карло), для получения максимальных апостериорных (MAP) оценок R 0 , эквивалентных оценкам максимального правдоподобия.

Показатели изменчивости были рассчитаны для эпидемиологической недели с 5 по 52, что соответствует периоду с 26 января 2020 г. по 26 декабря 2020 г., для MSA и 50 штатов, включающих несколько округов, путем объединения ежедневных подсчетов подтвержденных инфекций SARS-CoV-2 в уездный уровень. Для оценки изменчивости данные были получены из общедоступного репозитория GitHub, поддерживаемого The New York Times .

Полученные результаты

MSA с наибольшим количеством округов: Атланта (n = 29 округов), Вашингтон (n = 25 округов или эквивалентов округов), Нью-Йорк (Нью-Йорк, n = 23 округа или эквиваленты округов) и Вирджиния-Бич (n = 19). округа или их эквиваленты). Оценки R 0 варьировались от 1,9 (для MSA, охватывающего Эпплтон, штат Висконсин) до 7,7 (для MSA, охватывающего Детройт, штат Мичиган) для относительной региональной восприимчивости к передаче SARS-CoV-2.

Разрозненные оценки R 0 показали, что характеристики населения, способствующие первоначальному распространению SARS-CoV-2, были неоднородными географически и в совокупности приводили к >4-кратной контагиозности SARS-CoV-2. Меры изменчивости были меньше для MSA по сравнению с мерами для перекрывающихся состояний.

Для всех трех показателей изменчивости гистограммы MSA показали сдвиги влево по отношению к таковым для штатов, что указывает на то, что риски передачи SARS-CoV-2 на уровне округов показали большую однородность для округов США в рамках MSA по сравнению с рисками внутри штатов. . Было обнаружено, что параметризация моделей для конкретных регионов согласуется с данными эпиднадзора за SARS-CoV-2 MSA США с > 200 кумулятивными случаями COVID-19, задокументированными до 21 мая 2020 г., и ≥ 5 новыми случаями инфекции SARS-CoV-2 на любой данный день в период с 21 января 2020 г. по 21 июня 2020 г. Критерию соответствовали 280 MSA США.

В целом результаты исследования показали, что заразность SARS-CoV-2 варьировалась в четыре раза в городских районах США. Полученные данные могут помочь в смягчении будущих вспышек легочных заболеваний, поскольку было обнаружено, что несколько городских районов гораздо более восприимчивы к быстрой передаче SARS-CoV-2, чем другие.

*Важное замечание

medRxiv публикует предварительные научные отчеты, которые не рецензируются экспертами и, следовательно, не должны рассматриваться как окончательные, направляющие клиническую практику/поведение, связанное со здоровьем, или рассматриваться как установленная информация.